數(shù)字PCR技術(shù)靈敏度高、可精準定量。那些多次采用實時熒光定量PCR方式進行核酸檢測,結(jié)果卻為陰性的病毒攜帶者,利用數(shù)字PCR技術(shù)就能準確地檢測出他們是陽性患者。
◎本報記者 華 凌
春節(jié)前后,國內(nèi)外新冠肺炎疫情仍在持續(xù)。當前肆虐的奧密克戎毒株,雖然引發(fā)的癥狀相對較輕,但其基因突變位點多,傳播速度快,不易被發(fā)現(xiàn),在多地成散發(fā)態(tài)勢。因此,針對奧密克戎的核酸檢測試劑,靈敏度要非常高。
近日,由清華大學醫(yī)學院生物醫(yī)學工程系教授郭永團隊與北京新羿生物科技有限公司(以下簡稱新羿生物)等多家單位,采用數(shù)字PCR技術(shù)聯(lián)合研發(fā)的新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒(熒光PCR法),正式獲得國家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)醫(yī)療器械批文。
據(jù)悉,這是NMPA首個基于數(shù)字PCR技術(shù)的新冠檢測試劑批文。該試劑盒也是全球首個經(jīng)評審后正式獲批的將數(shù)字PCR技術(shù)運用于感染性疾病領(lǐng)域的檢測產(chǎn)品。這意味著,在與新冠病毒的“戰(zhàn)斗”中,人類有了更精準的病毒檢測“神器”。
數(shù)字PCR技術(shù)是核酸檢測的標尺
2020年,新冠肺炎疫情暴發(fā)初期,核酸檢測試劑盒缺乏、患者確診困難等難題亟待解決,郭永敏銳地覺察到,由于新冠病毒低病毒載量樣本的存在,對于高靈敏度的核酸檢測有著迫切需求。靈敏度不夠或定量不準確,都可能會影響樣本陰陽性的判讀,造成漏判或誤判。
“PCR即聚合酶鏈反應(yīng),是一種在生物體外進行脫氧核糖核酸(DNA)復制的技術(shù)手段,它可以將生物體中含量微小的遺傳物質(zhì)如核酸分子等復制擴增為原有數(shù)量的近百億倍,從而實現(xiàn)核酸分子的超敏檢測和精準定量?!惫澜榻B。
得益于PCR技術(shù),無論是化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前的案件中嫌疑人所遺留的毛發(fā)、皮膚或血液,只要能分離出一丁點的DNA,就能用PCR技術(shù)加以放大,進行比對。自20世紀80年代問世以來,PCR技術(shù)幾經(jīng)更迭,到目前實時熒光定量PCR(qPCR)技術(shù)已成為臨床上分子診斷的主打技術(shù)。
然而,由于qPCR技術(shù)需要大體積反應(yīng)系統(tǒng),存在較多的背景干擾,且無法獲得絕對定量結(jié)果。隨著臨床檢測要求的提高,qPCR技術(shù)不能滿足臨床一些超高靈敏度、高精密度的檢測要求,臨床上急需新的檢測技術(shù)。為此,近10年來,被稱為“第三代PCR技術(shù)”的數(shù)字PCR技術(shù)開始迅速發(fā)展。
郭永介紹,“數(shù)字PCR技術(shù)的原理,就是把一份反應(yīng)液樣本,分散成幾萬個極微小的液滴,每個小液滴所在的反應(yīng)單元都包含零個、一個或多個拷貝的目標核酸分子,這些小液滴同時進行PCR擴增,最后通過計算熒光液滴數(shù)目,就可以計算出原來的反應(yīng)液當中有多少個目標核酸分子的拷貝數(shù)目了?!?/p>
郭永指出,“靈敏度高、可精準定量這兩大優(yōu)勢讓數(shù)字PCR技術(shù)在傳統(tǒng)方法難當重任時可‘挺身而出’,特別是在新冠病毒的核酸檢測中,那些多次采用qPCR技術(shù)方式進行核酸檢測,結(jié)果卻為陰性的病毒攜帶者,數(shù)字PCR技術(shù)卻能準確地檢測出他們是陽性患者。從這個意義上來說,數(shù)字PCR技術(shù)可謂是核酸檢測的標尺?!?/p>
“此次獲批上市的新冠病毒檢測數(shù)字PCR試劑盒,是在之前qPCR技術(shù)即第二代PCR技術(shù)的基礎(chǔ)上,借助微流控生物芯片,數(shù)字化顯示新冠病毒的拷貝數(shù),極大地提升了核酸檢測的‘信噪比’。其靈敏度可達100拷貝/毫升?!惫辣硎?。
新羿生物聯(lián)合創(chuàng)始人楊文軍博士說,在實際應(yīng)用中,這個試劑盒有效提高了檢測靈敏度,可以降低陽性漏檢情況。此外,這個“嗅覺”靈敏的“新冠探測器”對包括德爾塔株和奧密克戎株等在內(nèi)的目前全球范圍內(nèi)常見的15種變異株,均不會出現(xiàn)漏檢和脫靶。哪怕是樣本中僅有微量的新冠病毒,也難逃它的法眼?!皵?shù)字PCR技術(shù)為新冠肺炎疫情防控與核酸檢測提供了更精準的利器?!睏钗能娬f。
目前,數(shù)字PCR新冠檢測試劑盒已進入商務(wù)部抗疫出口物資白名單。
國內(nèi)企業(yè)開啟全鏈條式自主研發(fā)
數(shù)字PCR技術(shù)是生命科學和臨床診斷的關(guān)鍵技術(shù),更是核酸檢測領(lǐng)域的上游技術(shù),以前我國一直依靠國外引進。
近年來,國內(nèi)誕生的十余家數(shù)字PCR研發(fā)企業(yè)使這個市場迸發(fā)出新的生命力,以新羿生物為代表的一批新銳企業(yè)異軍崛起,包括領(lǐng)航基因科技(杭州)有限公司(以下簡稱領(lǐng)航基因)、蘇州銳訊生物科技有限公司、思納福醫(yī)療科技有限公司(以下簡稱思納福醫(yī)療)等在內(nèi)的數(shù)字PCR研發(fā)企業(yè)也開始與國外企業(yè)同臺競技,大力推進數(shù)字PCR技術(shù)及其產(chǎn)品的國產(chǎn)化進程,打破了進口壟斷。
2019年1月7日,浙江省藥品監(jiān)督管理局正式批準領(lǐng)航基因的生物芯片閱讀儀iScanner 5上市。該產(chǎn)品是領(lǐng)航基因繼2018年6月獲批國內(nèi)首款擁有完全獨立自主知識產(chǎn)權(quán)的固態(tài)芯片式數(shù)字PCR儀之后,推出的全新五色熒光液滴數(shù)字PCR系統(tǒng),大幅提升了數(shù)字PCR的多色熒光技術(shù)水平。此次獲批,標志著我國數(shù)字PCR臨床轉(zhuǎn)化走在了國際前列。
2020年,思納福醫(yī)療推出了全自動化數(shù)字PCR產(chǎn)品,這是首款國產(chǎn)一體化數(shù)字PCR儀,也是全球第三款上市的全自動化數(shù)字PCR產(chǎn)品,該產(chǎn)品將我國數(shù)字PCR技術(shù)提升到了國際頂尖水平。
“只有與專業(yè)團隊強強聯(lián)合,通過自主研發(fā)將核心技術(shù)掌握在自己手里,才能在激烈競爭中掌握主動權(quán)。”楊文軍表示,新羿生物與清華大學等聯(lián)合研發(fā)的數(shù)字PCR系統(tǒng)從核心原材料、芯片、儀器、軟件到臨床檢測試劑,整個檢測鏈條的各個環(huán)節(jié),均為自主研發(fā)成果。
據(jù)介紹,該團隊研發(fā)的數(shù)字PCR系統(tǒng)包含樣本制備儀和生物芯片分析儀,一次可以完成96個樣本的檢測,且無須手工移液,樣本擴增完成后,直接放入生物芯片分析儀中,即可進行信號讀取與分析。這兩款產(chǎn)品分別于2017年、2019年獲批。同時,針對不同病癥和用途,團隊還研發(fā)了不同的檢測試劑,通過“儀器+試劑”相互配合的方式,打出數(shù)字PCR檢測的“組合拳”,目前已開發(fā)出20多種檢測試劑。
將在重大疾病檢測上發(fā)揮作用
“實際上,感染性疾病正是數(shù)字PCR技術(shù)應(yīng)用的一大理想場景,它可用于新冠肺炎、乙肝、結(jié)核、艾滋病等比較重大的感染性疾病的早期和快速診斷。此外,數(shù)字PCR技術(shù)還可在腫瘤基因檢測、無創(chuàng)出生缺陷篩查兩大應(yīng)用場景中發(fā)揮用武之地。”楊文軍介紹。
比如,我國肺癌病人基數(shù)比較龐大,且治療藥物也較多,患者的用藥與其基因檢測結(jié)果直接相關(guān),傳統(tǒng)切片需要取樣后再做病理診斷,現(xiàn)在血液檢測取樣會更方便,而且數(shù)字PCR設(shè)備的檢測靈敏度也更高。
“至于無創(chuàng)出生缺陷篩查,以往更多依賴基因測序技術(shù)進行。”楊文軍說,“而且基因測序主要是在大城市的大醫(yī)院進行,到小城市推廣相對困難,而數(shù)字PCR設(shè)備操作簡單、成本更低,市場下沉更有優(yōu)勢?!?/p>
據(jù)了解,基于數(shù)字PCR技術(shù),我國已在腫瘤、出生缺陷和重大感染性疾病診斷方面開發(fā)了一系列新型分子診斷產(chǎn)品。
楊文軍表示:“今后對于這三大臨床應(yīng)用領(lǐng)域,這些產(chǎn)品會涵蓋一線需求,解決一些行業(yè)痛點?!?/p>